La gestion Javascript de Firefox est on ne peut plus basique : on peut les bloquer ou non. Alors que l'on peut définir une 'liste blanche' pour les popups, il n'est pas possible de le faire pour javascript.
On finit donc par en permettre l'exécution, afin de ne pas devoir changer les paramètres chaque fois que l'on visite son site favori et sûr, qui nécessite les scripts!
L'extension NoScript pour Firefox bloque tous les scripts par défaut, et vous permet de les activer temporairement ou définitivement pour les sites visités.