animaux-marins

ACTIVITÉS D'ENSEIGNEMENT :

Etablissement : UFR des Sciences, université du Maine

Discipline : Biologie

Principalement Licence L3 et MASTER 1 de Biologie

Nature (CM, TD, TP) et volume (nombre d'heures effectives) faisant référence à la fiche d'activité 2006-2007 :

            1) Ecologie animale : CM (12 h) + TP (8 h : sortie) pour les licences L3

            2) Evolution des génomes : CM (16h) + TD (20h) + TP (30) pour les licences L3

            3) Théories de l'évolution : CM (15h) + TD (10h) pour les licences L3

            4) Bioinformatique : CM (15h) + TD (5h) + TP (6h) pour le MASTER1 Biologie

            5) Physiologie animale : CM (11h) + TD (4h) + TP (24h) pour les licences L2, L3 et professionnelle

            6) Biologie des invertébrés et cellulaire : TD (1h) + TP (3h) pour les licences L1 et L2

            7) Biologie cellulaire : CM (10,5h) + TP (15h) pour la licence L1 et DAEU-B

2008.  Encadrement de MASTER1 Biologie. Thème: Caractérisation des gènes de HSP70 (protéine de stress) chez des gastéropodes (famille littorinidae) soumis aux rythmes des marées (Van Vinh TO, université du Maine, 100% encadrement).

2006. Encadrement de thèse de Biologie animale. Thème: Analyse de l'évolution phylétique de crustacés décapodes et de l'évolution moléculaire des éléments mobiles de la famille mariner présents chez ces organismes (M^lle Quynh Trang Bui, université du Maine, 2003-2006, 30% d'encadrement, mention très honorable avec félicitations orales du jury)

2006. Encadrement de MASTER2 "génomique fonctionnelle et santé". Thème: Caractérisation des gènes de HSP70 chez les crabes vivant en conditions extrêmes (milieu hydrothermal) : comparaisons structurales et évolution (Marie Cibois, université de Rennes I, 100% encadrement; mention Bien, 2^ème au classement final, 1^ère au stage)

2005. Encadrement de thèse de Biologie animale. Thème : Caractérisation des gènes de résistance aux intoxications métalliques chez les organismes filtreurs des sites hydrothermaux (modèle d'étude : moules) (Yann Hardivillier, université du Maine, 2002-2005, 40% d'encadrement, mention très honorable avec félicitations orales du jury).

2005. Encadrement de thèse de Biologie animale. Thème : Identification par une approche moléculaire des bactéries capables de décomposer les nouveaux films dits biodégradables à base de polymères naturels (maïs, tournesol) (Sandra Lefaux, université du Maine, 2002-2005, 10% d'encadrement, mention très honorable avec félicitations orales du jury)

2005. Encadrement de MASTER1 Biologie. Thème : Caractérisation des gènes de l'ubiquitine (protéine de stress) chez les invertébrés hydrothermaux (Emeric Abraham, université du Maine, 100% encadrement, 5^ème au classement final, 3^ème au stage). 

2004. Encadrement de MASTER2 "Génomique et Informatique". Thème: Conception d'une base de données sur les éléments transposables de type Mariner-like elements (MLEs database) et réalisation d'analyses bioinformatiques (Gabriel Uguen, université de Rennes I, 30% d’encadrement, 1^er au stage).

2003. Encadrement de MASTER1 Biologie. Thème : Caractérisation des séquences codantes des métallothionéines chez la moule Hydrothermale Bathymodiolus azoricus  (Bivalvia, Mytilidae) (Gabriel Uguen, université du Maine , 100% encadrement, 4^ème au classement final, 2^ème au stage).

2002. Encadrement de MASTER1 Biologie. Thème : Caractérisation des gènes des métallothionéines (protéines de stress induites lors d' intoxications métalliques) chez  la moule littorale Mytilus edulis (Bivalvia, Mytilidae) (Nicolas Piette, université du Maine, 100% encadrement, 5^ème au classement final, 1^er au stage).

2008. Concepteur et réalisateur de l'exposition « Les Génies de l’Evolution», 1 Avril – 1 mai (exposition à l’université du Maine conjointement avec la médiathèque du Mans, le musée vert, la ville du Mans, le musée de Lausanne)  + articles de presse dans les journaux locaux (Ouest France, Presse Océan)

2008. Participation à la soirée - cafés des sciences « thème : la mer », présentation orale du milieu hydrothermal. 8 avril 2008.

2008. Conférence « Les fabuleux animaux des sites hydrothermaux profonds» 10 avril (musée vert au cours de l’exposition « les animaux fabuleux »).

2007. Participation aux réflexions de la grenelle de l’environnement à la demande de la préfecture de la Sarthe (Laval, 10 octobre)

2007. Concepteur et réalisateur de l'exposition "la recherche biologique au niveau des dorsales océaniques profondes et ses aboutissants". 27 octobre 2006 (projet labellisé fête de la Science, université du Maine).

2007. Concepteur et réalisateur de l'exposition "Attention animaux venimeux", du 15 janvier au  13 mai 2007 (musée d'histoire naturelle du Mans, musée vert). + articles de presse dans les journaux locaux (Ouest France, Presse Océan)

2006. Concepteur et réalisateur de l'exposition "les pollutions et la santé".4-5 octobre 2006 (fête de la Science, université du Maine).

2006. Concepteur et réalisateur de l'exposition "les migrations: l'ADN raconte", du 15 décembre 2005-30 juillet 2006 (musée d'histoire naturelle du Mans, musée vert). + articles de presse dans les journaux locaux (Ouest France, Presse Océan)

2005. Emission « un métier, une vie » (45 min), radio « Alpes mancelles » (14/12/05).

2003. Organisateur de la conférence du 29 avril 2003 "Les marais de l’Erdre: Histoire, Richesse et Protection d’un patrimoine écologique fragile" (orateur invité : Maisonneuve JL, syndicat mixte d’Eden).

Depuis 2002   

je suis "maître de conférences en Biologie" à l'Université du Maine. MCU67.

2000-2001  Assistant Temporaire d'Enseignement Recherche (demi-ATER) au laboratoire de Biologie et Génétique Evolutive (thème de recherche: caractérisation des gènes de protéines de stress chez les organismes marins hydrothermaux). Université du Maine. ATER

1997-2000  Thèse de Biologie (discipline: Biologie des populations et Ecologie) (thème des travaux de recherche: diversité génétique et étude de l'installation des gènes de résistance à certains antiparasitaires (benzimidazoles) chez des nématodes parasites de petits ruminants). Stage pratique : INRA de Tours-Nouzilly. Université de Montpellier II. Bac+8

1996-1997  Diplôme d'Etudes Approfondies (discipline: Biologie des populations et Ecologie); thème de stage pratique au centre INRA de Tours/Nouzilly : établissement des liens de parenté entre les espèces de nématodes parasites pulmonaires de Sanglier). Université de Montpellier II. Bac+5

1996           Stage en laboratoire pendant 8 mois à l'INRA de Tours-Nouzilly (thème : variabilité génétique de certaines espèces de nématodes parasites digestifs de petits ruminants). Centre INRA, laboratoire d'Ecologie et génétique des parasites. Stage recherche

1995           Stage en laboratoire (6 mois) en Espagne (Echange international, ERASMUS); thème : adaptation de la morphologie des vers parasites (Trématode) aux hôtes rongeurs). Université Valencìa. Tésina de Biologie des populations et de parasitologie

1993-1995   Licence et maîtrise "Biologie des organismes et des populations". Faculté des Sciences d'Orléans, Université Tours-Orléans. Bac +4

1990-1993  Diplôme d'Etudes Universitaires Générales "Sciences de la nature et de la vie". Faculté des Sciences, Université de Nantes. Bac +2

2007.               Leignel, Cibois, Moreau, Marchand, Chénais. Caractérisation des gènes de réponse aux stress environnementaux chez les crabes hydrothermaux. Ière Journée Stress Oxydant, Rennes I, 28 juin.

2006.               Leignel, Cibois, Moreau, Chénais. Quelle est l'origine des décapodes hydrothermaux ? deux scénarios proposés par les analyses phylogénétiques. Colloque Journées annuelles Société Française de Systématique "nouvelles de la systématique" 04-06 octobre 2006. Paris.

2006.               Hardivillier, Leignel, Denis, Laulier. Metallothioneins in the hydrothermal vent mussels Bathymodiolus azoricus and B. thermophilus.11th Deep-Sea Biology Symposium", July 9-14, Southampton, UK

2006.               Cabaret, Leignel. L'évolution des nématodes Trichostrongles : arbre ou réseau ? Colloque Journées annuelles Société Française de Systématique "nouvelles de la systématique" 04-06 octobre 2006. Paris. 

2006.               Bui, Casse, Leignel, Nicolas, Laulier, Chénais. Evolution of Mariner Like Elements in Brachyura (Decapoda, Crustacea) and comparison between the evolution of these elements and the phylogenetic evolution of their hosts. 10^th Evolutionary Biology Meeting, 20-22 september.  Marseille.

2006.               Bui, Casse, Leignel, Nicolas, Laulier, Chénais. Evolution moléculaire des éléments mobiles de la famille mariner présents chez les crabes (Brachyura) marins. XIV^ème colloque Elements Transposables. Clermont-Ferrand

2004.               Casse, Bui, Uguen, Demattei, Pradier, Leignel, Bigot et Laulier. Occurrence of Mariner transposons in organisms from deep-sea hydrothermal and coastal environments . XII^ème colloque Eléments Transposables – Tours.

2004.               Uguen, Hardivillier, Casse, Leignel, Laulier. Conception d'une base de données sur les éléments transposables de type Mariner -like elements (MLEs database) et réalisation d'analyses bioinformatiques – XII^ème colloque Elements Transposables . Tours.

2001                Denis, Vachoux, Gauvry, Leignel, Salin, Hardivillier, Cosson. Laulier. Metallothionein in Bathymodiolus sp : Complementary DNA characterization and quantification of expression.. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology. Brest .

2000.               Leignel, Cabaret et Humbert. Analyse de la variabilité mitochondriale dans les populations de Teladorsagia circumcincta (nématode de petits ruminant) résistantes et sensibles aux benzimidazoles. XXII réunion du groupe de Biologie et Génétique des populations, “ Petit Pois Déridé ”.

2000.               Leignel , Humbert et Cabaret . Effets de l'utilisation alternée de deux anthelminthiques sur la sélection de génotypes résistants. Congrès de la Société française de Parasitologie.

1999.               Leignel, Humbert et Cabaret . Evolution of the benzimidazole resistance in a population of Teladorsagia circumcincta submitted to different anthelmintic treatments. World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology.

1997.               Leignel et Humbert. Etude taxonomique de 4 espèces de métastrongles par utilisation de la RAPD et du séquençage de l'ITS2 de l'ADNr. Congrès de la Société française de Parasitologie.

2008.               Bui, Q.T., Casse, N., Leignel V., Nicolas V., Chénais B. Occurrence of Mariner transposons in coastal crabs. Congrès international des éléments transposables, Saint Malo, 21-23 Avril.

2007.               Marchand J., Leignel V., Moreau B., Chénais B. Les crabes hydrothermaux (Decapoda, Bythograeidae) présentent-ils des gènes de SuperOxyde Dismutase (SOD) spécifiques reflétant leur adaptation à leur milieu ? IIème Journée Stress Oxydant, Rennes I, 16 nov.

2006.               Leignel, Van Wormhoudt, Bui, Ravallec, Laulier. Evidence of phylogenetic molecular proximity between hydrothermal (Alvinocarididae, Mirocarididae) and Deep-sea (Nematocarcinidae, Oplophoridae) shrimp families. 11th Deep-Sea Biology Symposium, July 9-14, Southampton, UK

2006.               Bui, Laulier, Leignel. Etablissement de la phylogénie des portunidés vietnamiens (Portunidae, Brachyura, Decapoda) basée sur l'information du gène 16S (ARN ribosomal). Colloque Journées annuelles Société Française de Systématique "nouvelles de la systématique" 04-06 octobre 2006. Paris.

2006.               Cibois, Leignel, Moreau, Laulier, Chénais. Molecular particularism and structural adaptations of HSP70 (Heat Shock Protein 70 kDa) genes from hydrothermal crabs (Bythograeidae, Eubrachyura). 11th Deep-Sea Biology Symposium, July 9-14, Southampton, UK

2006.               Cibois, Moreau, Chénais, Leignel. The HSP70 and HSC70 in invertebrates/vertebrates : structural comparisons and evolution. 10^th Evolutionary Biology Meeting, 20-22 september.  Marseille.

2005.               Bui, Leignel, Casse, Moreau, Chénais, Laulier. Caractérisation des transposons Mariner Like Elements (MLEs) chez diverses familles de crabes. XIII^ème Colloque Eléments Transposables- Paris.

2005.               Hardivillier, Denis, Leignel, Chénais, Shillito, Cosson, Laulier. Caractérisation et expression des gènes de métallothionéines chez Bathymodiolus azoricus. Congrès Annuel et Forum Jeunes Chercheurs de la société française de Biochimie et Biologie moléculaire (SFBBM) / Nantes.

2004.               Uguen , Hardivillier, Casse, Leignel et. Laulier. MLEs database, an innovative on line source of information on Mariner-Like Elements. XII^ème colloque Elements Transposables- Tours. (5)

2002.               Hardivillier, Leignel, Denis et Laulier. Cloning of a metallothionein gene and characterization of a cDNA sequence in the hydrothermal mussel, Bathymodiolus sp. Forum des jeunes océanographes - Nantes - Salon Seamer.

2001.               Leignel et Cabaret . Haemonchidae phylogeny based on molecular data. World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology.

1999.               Leignel, Humbert et Cabaret . Teladorsagia circumcincta species complex in goats. World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology.

1999.               Leignel , Cabaret et Humbert . La résistance aux benzimidazoles chez les parasites de ruminants : mise au point de protocoles de traitements limitant la sélection de mutants résistants. 2^ème réunion biennale de Parasitologie CNRS/DGA/DCSSA/MENESR.

1998.               Leignel , Cabaret et Humbert . Chez les chèvres, un Teladorsagia peut en cacher un autre. XX^ème réunion annuelle du Groupe de Biologie et Génétique des populations.

1995.               Leignel , Valero, Mas-Coma . Variabilidad morfoanatomica intraspecifica del adulto de Corrigia vitta (Dujardin, 1845) (Digenea, Dicrocoeliidae), parasito pancreatico de micromamiferos en las islas gimnesicas (Baleares, España). IV congrès ibérique de Parasitologie de Santiago de Compostela.

2008.               Leignel V., Marchand J., Moreau B., Chénais B. (in press). Metallothionein genes from hydrothermal crabs (Bythograeidae, Decapoda) : Characterization, sequence analysis, gene expression and comparison with coastal crabs. Comparative Biochemistry and Physiology Part C Indice 2006 : 1,99.

2008.               Bui Q.T., Casse N., Leignel V., Nicolas  V., Chénais B. (in press). Widespread occurrence of mariner transposons in coastal crabs. Molecular Phylogenetics and Evolution. Indice 2006 : 3,5.

2007.               Leignel V., Cibois M., Moreau B., Chénais B. 396 (1): 84-92. Identification of new subgroup of HSP70 in Bythograeidae (hydrothermal crabs) and Xanthidae. Gene. 396, 84-92 Indice 2006 : 2,7.

2006.               Leignel V. and Laulier M. 142(1-2): 12-18. Isolation and Characterization of Mytilus edulis Metallothionein genes. Comparative Biochemistry and Physiology, Part C. Indice 2006 : 1,99

2005.               Leignel V., Hardivillier Y. and Laulier M. May-Jun;7(3):236-44 Small metallothionein MT-10 genes in coastal and hydrothermal mussels. Marine Biotechnology. Indice 2006 : 2,4.

2004.               Hardivillier Y., Leignel V., Denis F., Uguen G., Laulier M. 139(1-3): 111-118 2004 Do organisms living around hydrothermal vent sites contain specific metallothioneins? The Case of the genus Bathymodiolus (Bivalvia, Mytilidae). Comparative Biochemistry and Physiology Part C Indice 2006 : 1,99.

2003.               Lefaux, S., Manceau, A., Benguigui, L., Campistron, I., Laguerre, A., Laulier, M., Leignel, V., Tremblin, G. Continuous automated measurement of carbon dioxide produced by microorganisms in aerobic conditions: application to proteic film biodegradation. C.R.A.S. Chimie. Indice 2002 : 0,555.

2002.               Denis, F., Vachoux, C., Gauvry, L., Leignel, V., Salin, C., Hardivillier, Y., Cosson, R., and Laulier, M. 43: 329-32. Characterization and expression of the Bathymodiolus sp. metallothionein gene. Cahier Biologie Marine. Indice 2006 : 0,49.

2002.               Silvestre A., Leignel V., Berrag B., Gasnier N., Humbert J.F., Chartier C., Cabaret J.  Sep-Oct;33(5):465-80. Review. Sheep and goat nematode resistance to anthelmintics: pro and cons among breeding management factors. Veterinary Research. Indice 2006 :3,15.

2002.               Leignel V., Cabaret J., Humbert J.F. Feb;88(1):135-40 New molecular evidence that Teladorsagia circumcincta (Nematoda: Trichostrongylidea) is a species complex. Journal for Parasitology. Indice 2006 : 1,78.

2001.               Leignel V., Humbert J.F.  Nov-Dec;92(6):503-6 Mitochondrial DNA variation in benzimidazole-resistant and -susceptible populations of the small ruminant parasite Teladorsagia circumcincta. Journal of  Heredity. Indice 2006: 1,94.

2001.               Humbert J.F., Cabaret J., Elard L., Leignel V., Silvestre A. Nov 22;101(3-4):405-14. Molecular approaches to studying benzimidazole resistance in trichostrongylid nematode parasites of small ruminants. Veterinary Parasitology. Review. Indice 2006 : 1,9.

2001.               Leignel V., Cabaret J. Sep;87(9):687-92 Are Teladorsagia circumcincta (Nematoda) morphs equally able to survive under anthelminthic treatment in sheep on pastures? Parasitology Research. Indice 2006 : 1,14.

2001.               Leignel V., Cabaret J. 15, 569-574 Massive use of chemotherapy influences life-traits of parasitic nematodes in domestic ruminants. Functional Ecology. Indice en 2006 : 3,147.

1997.               Leignel V., Humbert, J.F., Elard L. Aug;83(4):606-11 Study by ribosomal DNA ITS 2 sequencing and RAPD analysis on the systematics of four Metastrongylus species (Nematoda:Metastrongyloidea). Journal for Parasitology. Indice 2006 : 1,3.

Chaque animal possède des patrimoines génétique, physiologique et comportemental qui lui confèrent l'aptitude à survivre dans son milieu. Ces particularités sont parfois inscrites dans son information génétique dont le reflet est la structure et la nature même de ses gènes. Mon approche se focalise sur la recherche de particularisme génétique des invertébrés en réponse aux xénobiotiques (produits non naturels ou composés naturellement présents dans l'environnement mais en forte concentration) et aux variations de paramètres physico-chimiques (température, taux d’oxygène…).

La question à laquelle une partie de la communauté scientifique,dont je fais partie,  tente de répondre est de savoir : Comment les animaux se sont-ils adaptés à leur environnement de vie parfois très particulier (par exemple les sites hydrothermaux profonds, sites aquatiques pollués, sol avec des contaminants)?

Mes modèles sont à la fois des organismes terrestres (nématodes) et aquatiques (annélides, bivalves, crustacés, vestimentifères...).

1) Etude structurale des gènes et des protéines chez des organismes marins vivant en conditions environnementales distinctes (littoral, profond, hydrothermal…) afin de déceler des adaptations structurales particulières.

2) Caractérisation et étude de gènes intervenant dans la réponse des organismes aux xénobiotiques (invertébrés marins, dulcicoles ou parasites).

3) Etablissement de phylogénie (recherche des liens de parenté) par une approche moléculaire au sein de groupes taxonomiques d'intérêt.

MOTS CLES DES ACTIVITÉS DE RECHERCHE

Biologie adaptative, invertébrés, stress, Heat-Shock-Protein, metallothionein, rDNA, mtDNA, phylogénie moléculaire.

EXAMINATEURS pour plusieurs revues internationales